原创 高性能计算之案例——硬件平台建设

戴尔解决方案——深圳华大基因研究院，基因破译，数据量大

                                北京信息职业技术学院：3D动画

曙光解决方案——中国医学科学院原生物研究所，计算节点，胖节点、IO节点

 重要指标：浮点运算峰值的计算、存储规模

                                苏州气象局，其网络拓扑与才略科技模型相同，Infinistrongand网络

浮点运算峰值计算：理论浮点峰值=CPU主频*CPU每个时钟周期浮点运算的次数*系统中CPU的个数

                                    实测浮点峰值：Linpack值，机器上运行Linpack测试程序得到的实际计算峰值；

中国传媒大学高性能计算方案：

作业管理软件：Open PBS

集群系统管理软件：NPACI Rocks

千兆访问IO节点，IO节点到存储为光纤，SAN存储架构

核心交换网络：Myrine交换机，服务器配置双端口Myrinet接口卡

专用互联技术：

Myrinet技术：带宽单链路2.5G,相对于Infiniband较低，技术较成熟，较早应用于专用网络互连，目前有10G

Infiniband技术：40GB/20GB

RDMA技术：零拷贝技术，让计算机可以通过网络直接将数据传输到另外一台计算机的内存中，减少了对带宽和处理器开销，传统的数据传输需要将数据从系统缓存Copy到目标存储中

Infiniband 应用——RDMA，ISER（iSCSI RDMA )用于存储系统协议传输

ToE传输卸载引擎技术：TOE（TCP/IP Offloading Engine）技术，将上述主机处理器的工作转移到网卡上。需要在主机上安装的网卡支持ToE, 既ToE与NIC结合，TONIC。

存储网络：

SAN结构——I/O节点

集群存储——Lustre并行文件系统，元数据、存储节点，分为一级存储和二级备份存储

                       IBM GPFS文件系统