硬件部分：
一：用户自定义设计好之后，将其按照Avalon总线规范进行封装，添加到系统中，如下，添加新的component，即你的世设计
添加完你的component，在tools-options下指定你的设计的路径，防止下一次打开后找不到你的设计
二：将你需要的IP添加到你的系统中，部分IP是设计好的，部分可能需要你自己进行设计，共同的特点是需要Avalon总线封装。
IP添加完之后，为每个模块分配基地址和中断，这些都是自动的，一般没有必要进行修改。
分配完之后点击generate即可产生你的Nios II系统了。。这个过程比较长，主要会产生很多硬件信息，为下面的软硬件设计做准备。
三：新建一个bdf文件，将生成的硬件电路图加入其中，添加输入输出管脚及其他模块，如锁相环等，
分配管脚，每个开发板在买的时候可能都会提供一个管脚配置文件，只需按照相应的名称命名然后自动导入即可，
最后综合，时序分析。。硬件部分完成。
软件部分：
一：新建工程，
二：指定硬件信息文件（ptf文件，在上面generate时会产生），选择工程模版
三：选择system library的一些属性，便于编译等工作
四：编写代码，调试，直到ok，下载硬件信息
四：下载软件代码，完毕
参考书籍：
这些很容易在网上找到
Avalon总线规范.pdf
NIOSII那些事儿REV7.0.pdf
NIOS最佳教程.pdf
挑战Soc--基于Nios的SOPC设计与实践.pdf
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