针对大型高海拔空气簇射观测站水基切伦科夫探测阵列标定方法，提出了一种远距离时间刻度系统方案，并完成了相关软硬件设计。该系统主要包括同步触发单元、光源驱动单元和时间差测量单元3个部分。其中，同步触发单元和光源驱动单元以现场可编程逻辑门阵列FPGA为核心，功能分别为发送同步触发信号、驱动标定光源。时间差测量单元以时间数字转换器TDC7201为核心，用于测量多路触发信号之间的时间差。基于该系统进行了远距离触发实验，实验结果表明，多路触发信号经过远距离传输后的同步误差在100 ns内，满足探测阵列标定要求，为标定方案的实现以及水基切伦科夫探测阵列的进一步使用奠定了基础。