为了能够对网络安全进行有效的保证，并且提高计算机网络入侵检测的性能及效率，实现计算机网络入侵检测系统匹配算法的研究。首先，对计算机网络入侵检测的基本模型进行分析，提出计算机网络入侵检测系统多模式匹配算法，在计算机网络中融入匹配算法；之后，对计算机网络入侵检测系统的多模式匹配算法进行分析，设计基于多模式匹配算法的计算机网络入侵检测系统，然后对多模式匹配算法进行改进，提高算法有效性；最后，对比常规匹配算法，得到满足计算机网络入侵检测系统需求的算法。通过对提出的匹配算法进行研究，表示此算法能够在计算机网络入侵检测中使用，具备一定实用性。