在小型化高能电子探测器原理样机研制中，为满足探测器大量数据传输的需求，设计基于FPGA与USB2.0协议的数据传输系统。传输系统采用Xilinx公司的sparten-6系列作为主控芯片，以EZ-FX2LP系列CY7C68013A作为接口芯片，VC++开发上位机程序。文章阐述了高能电子探测器设计与传输系统的设计。测试结果表明，该传输系统数据双向传输准确，达到探测器数据传输需求。